Pada bulan Maret tahun 2023, FIBAA telah mengumumkan hasil akreditasi internasional FIBAA. FIBAA telah melakukan Asesmen Lapangan pada bulan Oktober 2022. FIBAA merupakan lembaga penjaminan mutu perguruan tinggi yang berbasis di Bonn, Jerman dan telah diakui oleh Ditjen Diktiristek RI. Sebanyak 18 program studi di UIN Sunan Kalijaga memperoleh akreditasi FIBAA dengan 13 program studi mendapatkanQuality Seal Awardstanpa syarat dan 5 program studi meraihPremium Seal AwardsdariFoundation for International Business Administration Accreditation(FIBAA).

18 Prodi UIN Sunan Kalijaga yang mendapat akreditasi internasional tersebut adalah Prodi Studi Islam (S3), Pendidikan Bahasa Arab (S1), Pendidikan Agama Islam (S1), Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah (S1), Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah (S2), Pendidikan Islam Anak Usia Dini (S1), Pendidikan Islam Anak Usia Dini (S2), Manajemen Pendidikan Islam (S1), Ilmu Hadis (S1), Studi Agama-Agama (S1), Ilmu Al Qur’an dan Tafsir (S1), Akidah dan Filsafat Islam (S1), Bimbingan dan Konseling Islam (S1), Pengembangan Masyarakat Islam (S1), Sosiologi (S1), Ilmu Komunikasi (S1), Perbankan Syariah (S1) dan Manajemen Keuangan Syariah (S1).